Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案能夠提供單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組3'基因表達(dá)和多組學(xué)功能,可同時(shí)對(duì)成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞進(jìn)行分析。通過(guò)結(jié)合單細(xì)胞水平的基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)或CRISPR編輯,可以探索細(xì)胞異質(zhì)性,鑒定新的靶點(diǎn)及生物標(biāo)志物。
高通量單細(xì)胞分析 | 多組學(xué)細(xì)胞讀數(shù) | 可擴(kuò)展的功能基因組學(xué) | |||
捕獲樣本中成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞的完整異質(zhì)性。 | 可檢測(cè)3’ mRNA、細(xì)胞表面蛋白、CRISPR擾動(dòng)及其他。 | 通過(guò)配對(duì)的CRISPR敲除和全轉(zhuǎn)錄組讀數(shù)來(lái)探索基因網(wǎng)絡(luò)。 | |||
簡(jiǎn)化的數(shù)據(jù)分析 | 為期一天的實(shí)驗(yàn)室流程 | 兼容不同的樣本 | |||
使用易用的軟件來(lái)探索和解釋單細(xì)胞基因表達(dá)譜。 | 在一天之內(nèi)完成從樣本到可測(cè)序文庫(kù)的過(guò)程。 | 經(jīng)驗(yàn)證適用于固定、新鮮和冷凍的樣本,以及完整的細(xì)胞和細(xì)胞核。 |
通過(guò)單細(xì)胞多組學(xué)探索您的應(yīng)用
靈活的解決方案 滿足您各種需求
單細(xì)胞基因表達(dá)的標(biāo)準(zhǔn) | ||
開(kāi)啟您的單細(xì)胞基因表達(dá)實(shí)驗(yàn)--使用可以負(fù)擔(dān)的適用于小型項(xiàng)目的解決方案進(jìn)行試點(diǎn)研究或優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件。
單細(xì)胞基因表達(dá)低通量解決方案 | ||
開(kāi)啟您的單細(xì)胞發(fā)現(xiàn)之旅。僅需100-1,000個(gè)細(xì)胞即可進(jìn)行試點(diǎn)研究,啟動(dòng)初步研究或進(jìn)行樣本制備優(yōu)化。 | ||
觀看產(chǎn)品網(wǎng)絡(luò)研討會(huì) > | ||
獲得初步見(jiàn)解 | 優(yōu)化樣本制備 | 從樣本制備到數(shù)據(jù)分析的全面支持 |
通過(guò)小規(guī)模研究,從100-1,000個(gè)細(xì)胞中找到可揭示的內(nèi)容。 | 優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件,提高您的研究成功率。 | 從技術(shù)資源到用戶友好的基于云的數(shù)據(jù)分析都將為您提供端到端的支持。 |
同時(shí)測(cè)量細(xì)胞表面蛋白表達(dá)或CRISPR擾動(dòng)與基因表達(dá)。
CRISPR篩選 | |
通過(guò)對(duì)細(xì)胞內(nèi)sgRNA的直接捕獲和基因表達(dá)的變化,以單細(xì)胞分辨率評(píng)估CRISPR擾動(dòng)帶來(lái)的影響。 | |
查看信息圖 > | |
| |
| |
| |
細(xì)胞表面蛋白 | |
綜合分析單細(xì)胞的基因和蛋白表達(dá),以便發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞亞群和罕見(jiàn)的細(xì)胞群體。 | |
| |
| |
單細(xì)胞基因表達(dá)Flex
Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)Flex能夠提供單細(xì)胞基因表達(dá)和混樣功能,以分析數(shù)百到一百萬(wàn)個(gè)細(xì)胞。在樣本采集點(diǎn)進(jìn)行固定可保留脆弱樣本的生物學(xué)特征,并大大簡(jiǎn)化工作流程,帶來(lái)更多樣本的生物學(xué)見(jiàn)解。
通過(guò)Chromium Connect 單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案獲得一致性高、重復(fù)性好的結(jié)果,大大提高實(shí)驗(yàn)室生產(chǎn)力。
完整的解決方案
基于Next GEM技術(shù)的Chromium儀器 Chromium X Series 通量靈活、可拓展 Chromium Controller 小巧靈活 Chromium Connect 自動(dòng)化 |
Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)試劑 利用我們的試劑盒,您可以捕獲和擴(kuò)增3’ mRNA,鑒定CRISPR擾動(dòng)或開(kāi)展其他應(yīng)用。 | 分析和可視化軟件
Cell Ranger 數(shù)據(jù)分析流程 Loupe Browser 數(shù)據(jù)可視化軟件 | 世界級(jí)的技術(shù)支持和客戶支持 您可以通過(guò)電話或電子郵件聯(lián)系我們的 專家支持團(tuán)隊(duì)。 |
工作流程
單細(xì)胞基因表達(dá)的基本工作流程如下所示。若您使用我們的Feature Barcode試劑盒來(lái)分析CRISPR或細(xì)胞表面蛋白,我們將會(huì)提供其他方案用于修飾您感興趣的蛋白。
樣本制備 從成百上千個(gè)細(xì)胞開(kāi)始。按照洗滌、計(jì)數(shù)和濃縮細(xì)胞的高效做法,盡量減少細(xì)胞團(tuán)塊的存在,回收高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液。 | 文庫(kù)構(gòu)建 利用我們的試劑盒和Chromium Controller構(gòu)建帶有10x條形碼的文庫(kù)。 Chromium Controller將每個(gè)帶有10x條形碼的凝膠珠的細(xì)胞封裝在單個(gè)液滴中。在每個(gè)納升級(jí)的液滴中,細(xì)胞經(jīng)過(guò)逆轉(zhuǎn)錄生成cDNA,其中單個(gè)細(xì)胞的所有cDNA都帶有共同的10x條形碼。 | 測(cè)序 第2步所生成的10x條形碼文庫(kù)與Illumina測(cè)序儀上的標(biāo)準(zhǔn)短讀長(zhǎng)NGS測(cè)序兼容,能夠?qū)崿F(xiàn)數(shù)千個(gè)單細(xì)胞的大規(guī)模轉(zhuǎn)錄分析。 |
數(shù)據(jù)分析 我們的Cell Ranger分析軟件可生成每個(gè)細(xì)胞的表達(dá)譜,鑒定表達(dá)譜相似的細(xì)胞簇,還能夠?qū)Χ鄠€(gè)樣本的數(shù)據(jù)進(jìn)行合并分析。 分析流程輸出 輸出結(jié)果包括質(zhì)控信息和文件,這些文件可輕松用于Loupe可視化軟件或第三方R工具及Python工具的進(jìn)一步分析。 | 數(shù)據(jù)可視化 利用我們的Loupe Browser可視化軟件,您可以交互式地探索實(shí)驗(yàn)結(jié)果,研究目的基因的表達(dá)模式,確定細(xì)胞類型,并開(kāi)展細(xì)胞簇和樣本之間的比較分析。 只有生物信息專家才能使用嗎? Loupe是點(diǎn)選式軟件,任何人都可以輕松下載和使用。 |
常 見(jiàn) 問(wèn) 題
Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)能夠?qū)崿F(xiàn)哪種分析?
它提供了一種全面的方法,來(lái)分析基因表達(dá)(全轉(zhuǎn)錄組或靶向),以及細(xì)胞表面蛋白或CRISPR編輯對(duì)復(fù)雜生物學(xué)的多維見(jiàn)解。
能夠分析哪些類型的RNA?
只要是表達(dá)聚腺苷酸化mRNA分子的細(xì)胞類型,都與該單細(xì)胞RNA-seq流程兼容。
與哪些類型的樣本兼容?
Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)與新鮮、固定(甲醇)和冷凍的單細(xì)胞或單細(xì)胞核懸液兼容。兼容的物種包括人、小鼠、大鼠、模式生物以及植物。
如何分析我的單細(xì)胞數(shù)據(jù)?
10x Genomics提供了兩種類型的軟件,可幫助您分析數(shù)據(jù):Cell Ranger和Loupe Browser。Cell Ranger這款分析軟件能夠自動(dòng)生成每個(gè)細(xì)胞的表達(dá)譜,并鑒定表達(dá)譜相似的細(xì)胞簇。隨后,您可以利用Loupe Browser可視化軟件來(lái)交互式地探索實(shí)驗(yàn)結(jié)果。您可以從10x支持網(wǎng)站上免費(fèi)下載Cell Ranger和Loupe Browser。
細(xì)胞大小是否存在限制?
我們?cè)趦?nèi)部測(cè)試了直徑達(dá)到30微米的細(xì)胞。此外,許多客戶文獻(xiàn)也成功證明了對(duì)各類細(xì)胞的兼容性,如肝細(xì)胞、成纖維細(xì)胞和心肌細(xì)胞,它們的大小往往超過(guò)30微米。
相 關(guān) 產(chǎn) 品
產(chǎn)品 | 單細(xì)胞基因表達(dá) |
單細(xì)胞免疫分析 |
空間基因表達(dá) |
單細(xì)胞ATAC |
性能 |
|
|
|
|
擴(kuò)展應(yīng)用 |
|
|
|
|
儀器 |
|
|
|
|
友情鏈接: 10x Genomics官網(wǎng) 10x單細(xì)胞基因表達(dá) 10x技術(shù)支持 10x視頻中心