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產(chǎn)品線類別
10x Genomics 產(chǎn)品
Chromium 單細(xì)胞基因表達(dá)
時(shí)間:2024-02-02點(diǎn)擊:6503

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Resources:     獲取報(bào)價(jià)                      觀看工作原理                    下載產(chǎn)品說(shuō)明                 經(jīng)費(fèi)申請(qǐng)寫作協(xié)助                     單細(xì)胞購(gòu)買指南

 

Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案能夠提供單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組3'基因表達(dá)和多組學(xué)功能,可同時(shí)對(duì)成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞進(jìn)行分析。通過(guò)結(jié)合單細(xì)胞水平的基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)或CRISPR編輯,可以探索細(xì)胞異質(zhì)性,鑒定新的靶點(diǎn)及生物標(biāo)志物。


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高通量單細(xì)胞分析

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多組學(xué)細(xì)胞讀數(shù)

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可擴(kuò)展的功能基因組學(xué)

捕獲樣本中成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞的完整異質(zhì)性。

可檢測(cè)3’ mRNA、細(xì)胞表面蛋白、CRISPR擾動(dòng)及其他。

通過(guò)配對(duì)的CRISPR敲除和全轉(zhuǎn)錄組讀數(shù)來(lái)探索基因網(wǎng)絡(luò)。

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簡(jiǎn)化的數(shù)據(jù)分析

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為期一天的實(shí)驗(yàn)室流程

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兼容不同的樣本

使用易用的軟件來(lái)探索和解釋單細(xì)胞基因表達(dá)譜。在一天之內(nèi)完成從樣本到可測(cè)序文庫(kù)的過(guò)程。經(jīng)驗(yàn)證適用于固定、新鮮和冷凍的樣本,以及完整的細(xì)胞和細(xì)胞核。


通過(guò)單細(xì)胞多組學(xué)探索您的應(yīng)用



靈活的解決方案 滿足您各種需求

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單細(xì)胞基因表達(dá)的標(biāo)準(zhǔn)


Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案可以滿足您的各種需求--從處理大型項(xiàng)目到發(fā)現(xiàn)基因表達(dá)的多樣性,逐個(gè)細(xì)胞地進(jìn)行解析。


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獲得初步見(jiàn)解

開(kāi)啟您的單細(xì)胞基因表達(dá)實(shí)驗(yàn)--使用可以負(fù)擔(dān)的適用于小型項(xiàng)目的解決方案進(jìn)行試點(diǎn)研究或優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件。

單細(xì)胞基因表達(dá)低通量解決方案

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開(kāi)啟您的單細(xì)胞發(fā)現(xiàn)之旅。僅需100-1,000個(gè)細(xì)胞即可進(jìn)行試點(diǎn)研究,啟動(dòng)初步研究或進(jìn)行樣本制備優(yōu)化。
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獲得初步見(jiàn)解


優(yōu)化樣本制備


從樣本制備到數(shù)據(jù)分析的全面支持

通過(guò)小規(guī)模研究,從100-1,000個(gè)細(xì)胞中找到可揭示的內(nèi)容。


優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件,提高您的研究成功率。

從技術(shù)資源到用戶友好的基于云的數(shù)據(jù)分析都將為您提供端到端的支持。





多組學(xué)分析

同時(shí)測(cè)量細(xì)胞表面蛋白表達(dá)或CRISPR擾動(dòng)與基因表達(dá)。

CRISPR篩選                                                     2.png

通過(guò)對(duì)細(xì)胞內(nèi)sgRNA的直接捕獲和基因表達(dá)的變化,以單細(xì)胞分辨率評(píng)估CRISPR擾動(dòng)帶來(lái)的影響。

查看信息圖 >
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  • 篩選與疾病相關(guān)的新型基因靶點(diǎn)或耐藥性的驅(qū)動(dòng)因素

  • 通過(guò)更快的流程和更高的分辨率開(kāi)展功能性遺傳篩選

  • 揭示發(fā)育過(guò)程中復(fù)雜的基因調(diào)控通路

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細(xì)胞表面蛋白
 

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綜合分析單細(xì)胞的基因和蛋白表達(dá),以便發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞亞群和罕見(jiàn)的細(xì)胞群體。

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  • 通過(guò)額外的蛋白信息來(lái)豐富對(duì)不同細(xì)胞表型的認(rèn)識(shí)

  • 通過(guò)同步的單細(xì)胞檢測(cè)來(lái)探索轉(zhuǎn)錄組與蛋白組之間的關(guān)系

下載應(yīng)用指南 >







單細(xì)胞基因表達(dá)Flex

Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)Flex能夠提供單細(xì)胞基因表達(dá)和混樣功能,以分析數(shù)百到一百萬(wàn)個(gè)細(xì)胞。在樣本采集點(diǎn)進(jìn)行固定可保留脆弱樣本的生物學(xué)特征,并大大簡(jiǎn)化工作流程,帶來(lái)更多樣本的生物學(xué)見(jiàn)解。

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自動(dòng)化工作流程

通過(guò)Chromium Connect 單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案獲得一致性高、重復(fù)性好的結(jié)果,大大提高實(shí)驗(yàn)室生產(chǎn)力。

自動(dòng)化單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案

基于Chromium Connect的自動(dòng)化基因表達(dá)工作流程,助力您探索異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)新的目標(biāo)和生物標(biāo)志物,并以提高生產(chǎn)力來(lái)揭示復(fù)雜的細(xì)胞過(guò)程。2.png


優(yōu)化生產(chǎn)力

將您的工作流程標(biāo)準(zhǔn)化

流線操作

縮短手動(dòng)操作時(shí)間,從單細(xì)胞到可以測(cè)序的基因表達(dá)文庫(kù),實(shí)現(xiàn)無(wú)人值守的便捷。

在多個(gè)實(shí)驗(yàn)室、用戶、甚至多個(gè)站點(diǎn)生成一致且可重復(fù)的單細(xì)胞基因表達(dá)結(jié)果。

采用預(yù)先分裝的自動(dòng)化專屬試劑,這些試劑采用顏色編碼和2D條形碼,用于防錯(cuò)試劑跟蹤和加載。


完整的解決方案

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基于Next GEM技術(shù)的Chromium儀器

    Chromium X Series

    通量靈活、可拓展

    Chromium Controller

    小巧靈活

    Chromium Connect

    自動(dòng)化


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   Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)試劑

   利用我們的試劑盒,您可以捕獲和擴(kuò)增3’

   mRNA,鑒定CRISPR擾動(dòng)或開(kāi)展其他應(yīng)用。


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     分析和可視化軟件

        

         Cell Ranger

         數(shù)據(jù)分析流程

         Loupe Browser

         數(shù)據(jù)可視化軟件


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  世界級(jí)的技術(shù)支持和客戶支持


  您可以通過(guò)電話或電子郵件聯(lián)系我們的 專家支持團(tuán)隊(duì)。


工作流程

單細(xì)胞基因表達(dá)的基本工作流程如下所示。若您使用我們的Feature Barcode試劑盒來(lái)分析CRISPR或細(xì)胞表面蛋白,我們將會(huì)提供其他方案用于修飾您感興趣的蛋白。




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樣本制備


從成百上千個(gè)細(xì)胞開(kāi)始。按照洗滌、計(jì)數(shù)和濃縮細(xì)胞的高效做法,盡量減少細(xì)胞團(tuán)塊的存在,回收高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液。



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文庫(kù)構(gòu)建


利用我們的試劑盒和Chromium Controller構(gòu)建帶有10x條形碼的文庫(kù)。 Chromium Controller將每個(gè)帶有10x條形碼的凝膠珠的細(xì)胞封裝在單個(gè)液滴中。在每個(gè)納升級(jí)的液滴中,細(xì)胞經(jīng)過(guò)逆轉(zhuǎn)錄生成cDNA,其中單個(gè)細(xì)胞的所有cDNA都帶有共同的10x條形碼。




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測(cè)序


第2步所生成的10x條形碼文庫(kù)與Illumina測(cè)序儀上的標(biāo)準(zhǔn)短讀長(zhǎng)NGS測(cè)序兼容,能夠?qū)崿F(xiàn)數(shù)千個(gè)單細(xì)胞的大規(guī)模轉(zhuǎn)錄分析。


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數(shù)據(jù)分析


我們的Cell Ranger分析軟件可生成每個(gè)細(xì)胞的表達(dá)譜,鑒定表達(dá)譜相似的細(xì)胞簇,還能夠?qū)Χ鄠€(gè)樣本的數(shù)據(jù)進(jìn)行合并分析。


分析流程輸出

輸出結(jié)果包括質(zhì)控信息和文件,這些文件可輕松用于Loupe可視化軟件或第三方R工具及Python工具的進(jìn)一步分析。



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數(shù)據(jù)可視化


利用我們的Loupe Browser可視化軟件,您可以交互式地探索實(shí)驗(yàn)結(jié)果,研究目的基因的表達(dá)模式,確定細(xì)胞類型,并開(kāi)展細(xì)胞簇和樣本之間的比較分析。


只有生物信息專家才能使用嗎?

Loupe是點(diǎn)選式軟件,任何人都可以輕松下載和使用。






常 見(jiàn) 問(wèn) 題

  • Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)能夠?qū)崿F(xiàn)哪種分析?

    它提供了一種全面的方法,來(lái)分析基因表達(dá)(全轉(zhuǎn)錄組或靶向),以及細(xì)胞表面蛋白或CRISPR編輯對(duì)復(fù)雜生物學(xué)的多維見(jiàn)解。

  • 能夠分析哪些類型的RNA?

    只要是表達(dá)聚腺苷酸化mRNA分子的細(xì)胞類型,都與該單細(xì)胞RNA-seq流程兼容。

  • 與哪些類型的樣本兼容?

    Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)與新鮮、固定(甲醇)和冷凍的單細(xì)胞或單細(xì)胞核懸液兼容。兼容的物種包括人、小鼠、大鼠、模式生物以及植物。

  • 如何分析我的單細(xì)胞數(shù)據(jù)?

    10x Genomics提供了兩種類型的軟件,可幫助您分析數(shù)據(jù):Cell Ranger和Loupe Browser。Cell Ranger這款分析軟件能夠自動(dòng)生成每個(gè)細(xì)胞的表達(dá)譜,并鑒定表達(dá)譜相似的細(xì)胞簇。隨后,您可以利用Loupe Browser可視化軟件來(lái)交互式地探索實(shí)驗(yàn)結(jié)果。您可以從10x支持網(wǎng)站上免費(fèi)下載Cell Ranger和Loupe Browser。

  • 細(xì)胞大小是否存在限制?

    我們?cè)趦?nèi)部測(cè)試了直徑達(dá)到30微米的細(xì)胞。此外,許多客戶文獻(xiàn)也成功證明了對(duì)各類細(xì)胞的兼容性,如肝細(xì)胞、成纖維細(xì)胞和心肌細(xì)胞,它們的大小往往超過(guò)30微米。


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  產(chǎn)品


 單細(xì)胞基因表達(dá)


 

   單細(xì)胞免疫分析

 

   空間基因表達(dá)

 

   單細(xì)胞ATAC

  性能
  •   3’轉(zhuǎn)錄組基因在組織中的表達(dá)

  •   靶向基因表達(dá)

  •   多樣本混合檢測(cè)

  •   全長(zhǎng)配對(duì)的TCR/BCR序列

  •   5’全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)

  •   靶向基因表達(dá)

  •   3’轉(zhuǎn)錄組基因在組織中的表達(dá)

  •   靶向基因表達(dá)

  •   兼容FFPE組織切片和新鮮冷凍組織切片

  •   通過(guò)開(kāi)放染色質(zhì)分析進(jìn)行表觀基因組學(xué)研究

  擴(kuò)展應(yīng)用
  •   細(xì)胞表面蛋白

  •   CRISPR篩選

  •   多樣本混合檢測(cè)

  •   細(xì)胞表面蛋白

  •   抗原特異性

  •   CRISPR篩選

  •   免疫熒光蛋白共檢測(cè)

  •   –

  儀器
  •   Chromium X系列單細(xì)胞系統(tǒng)

  •   Chromium Controller

  •   Chromium Connect

  •   Chromium X系列單細(xì)胞系統(tǒng)

  •   Chromium Controller

  •   Chromium Connect

  •    Visium CytAssist

  •   Chromium X系列單細(xì)胞系統(tǒng)

  •   Chromium Controller

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友情鏈接:      10x Genomics官網(wǎng)                    10x單細(xì)胞基因表達(dá)                     10x技術(shù)支持                     10x視頻中心

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